Hai hãng trước đó đã ký kết Biên bản ghi nhớ hợp tác thương mại toàn diện vào năm 2017 và sẽ bắt đầu thực hiện các chuyến bay liên danh trên một số đường bay nội địa tại Việt Nam và quốc tế giữa hai nước do Vietjet vận hành.
Các đường bay liên danh gồm nội địa tại Việt Nam: Thành phố Hồ Chí Minh - Hà Nội; Thành phố Hồ Chí Minh - Đà Nẵng; Hà Nội - Đà Nẵng. Các đường bay quốc tế gồm: Hà Nội - Osaka. Riêng đường bay Hà Nội - Osaka được khai thác từ ngày 8/11/2018. Theo thoả thuận đã ký, Vietjet Air và Japan Airlines sẽ tiếp tục mở rộng mạng đường bay liên danh trên các đường bay giữa Nhật Bản và Việt Nam, đường bay nội địa tại Nhật Bản và Việt Nam của hai hãng trong thời gian tới.