ข้อตกลงฉบับนี้เคยได้ถูกคัดค้านจากเกษตรกรและนักเคลื่อนไหวเพื่อสิ่งแวดล้อมในยุโรปเนื่องจากอาจเกิดการแข่งขันที่ไม่ยุติธรรมและเกิดผลเสียต่างๆ
ในประเทศฝรั่งเศส ข้อตกลงฉบับนี้ก็ถูกตำหนิจากนักการเมืองทั้งฝ่ายซ้ายและฝ่ายขวา รวมทั้งสมาชิกบางคนในพรรคของประธานาธิบดี เอ็ม มานูเอล มาครง
อียูและเมอร์โคเซอร์ได้เริ่มการเจรจาทางการค้าอย่างไม่ราบรื่นตั้งแต่ปี 2000 โดยต้องหยุดการเจรจาถึงสองครั้งในปี 2004 และ 2010.