Arbre phylogénétique des souches du SARS-CoV-2 collectées au Vietnam jusqu'au 1er avril 2021. Photo: VOV

Développé conjointement avec l’Institut Pasteur de Hô Chi Minh-ville et l’Institut d’Hygiène et d’Épidémiologie, ce procédé technologique séquence le génome entier de quatre variants du coronavirus sur une longueur de 29.500 nucléotides. L’exactitude est quasiment absolue, a déclaré le professeur Truong Nam Hai, responsable du projet. 

«Au Vietnam, c’est le seul outil avec lequel il est possible de décoder intégralement le génome du virus. Les anciens procédés ne permettent de lire que de courtes chaînes génétiques d’environ 100-200 nucléotides qu’il est nécessaire de répéter plusieurs fois pour obtenir le génome complet. Pacbio est capable de lire de très longs morceaux sur des dizaines de milliers de nucléotides et son exactitude est quasiment absolue. Cela ne prend que 48 heures pour séquencer complètement le génome d’un virus.»

Avec PacBio, le Vietnam pourra être autonome dans le séquençage du SARS-CoV-2 et d’autres virus sans attendre les références internationales. Les données obtenues permettent d’identifier les origines du virus et le nombre de sources d’infection (F0) dans les foyers.